Selain warna, sebenarnya masih ada perbedaan lain dari Yamaha R3 dan R25 yang beredar di Indonesia.
Perbedaan itu adalah pada desain lampu sein, milik R3 pakai mika warna kuning dan bentuknya sedikit lebih besar.
(BACA JUGA: Pilu Dari Kabin Isuzu, 7 Tewas Terhantam Bus Dan Tergencet Beton)
Lalu untuk R3 juga dilengkapi reflektor atau mata kucing di fender depan dan belakangnya.
Yamaha Amerika sendiri menyiapkan R3 ini dalam tiga pilihan warna yakni biru dan hitam seperti yang ada di Indonesia, serta warna putih ini.