Walaupun generasi pertamanya masih beredar sampai tahun 2011, tapi pada tahun 2009 Astra Honda Motor meluncurkan Vario Techno sebagai Vario generasi kedua.
Datang dengan desain yang baru lebih sporty berkat lekukan-lekukan bodi yang lebih tajam, mesin yang dipakai masih sama dengan sebelumnya 110 cc, pun sistem pendingin cairan atau radiator masih tetap dipertahankan.
Pada generasi ini Vario Techno punya teknologi Combi Brake System (CBS).
Generasi Ketiga, Vario Techno 125 FI (2012-2015)
Pada tahun 2012 akhirnya AHM meluncurkan Vario dengan mesin yang lebih besar 125 cc, pada generasi ini juga Vario sudah lebih efisien soal BBM berkat teknologi PGM-FI.
Secara desain, masih mirip-mirip dengan desain Vario Techno 110, tapi selain kapasitas mesin yang lebih besar dan sistem pengabutan sudah injeksi, Vario Techno 125 FI juga punya fitur Idling Stop System (ISS) dan Alternating Current Generator (ACG) Stater.
Kapasitas mesinnya yang lebih besar, alhasil tenaganya melonjak menjadi 11,1 PS dan torsi 10,7 Nm.
Uniknya, walaupun 2012 sudah diperkenalkan Vario Techno bermesin 125 cc yang sudah injeksi, tapi sepertinya PT AHM ingin mempertahan skutik 110 cc bernama Vario hingga akhirnya Vario 110 eSP diluncurkan di 2014 menemani Honda BeAT.