Soal fitur keselamatan juga oke. Meski cuma 2, namun ia sudah dilengkapi airbag untuk supir dan penumpang depan.
Rem sudah dibekali ABS, EBD dan BA untuk meningkatkan keamanan saat rem darurat.
Toyota Avanza 1.3 E MT juga sudah punya Hill Start Assist yang sangat membantu driver karena ia bertransmisi manual.
Paling menarik adalah ia sudah dibekali Vehicle Stability Control yang efektif meningkatkan nilai keselamatannya saat bermanuver.