Juli 2006
Baca Juga: Mobil Bekas Toyota Avanza 2007 Buat Mudik Cocok, Irit Harganya Juga Murah Meriah
Merupakan facelift perdana dengan penyegaran grille dan bumper depan, lampu belakang serta warna interior.
Di sini, Avanza 1.3 manual tipe E dan G sudah menggunakan mesin berteknologi VVT-i.
Oktober 2008
Setahun berselang, penyegaran buat Avanza kembali dilakukan, namun kali ini berlaku untuk semua tipe.
Misalnya perubahan desain foglamp (S & G), lalu perubahan desain bumper, center mesh bumper, adanya roof lining, penambahan ornamen krom pada pintu belakang (S & G).
Kemudian di bagian outer mirror (S) dan side body moulding (S), juga tersedia warna baru; wine red dan dark grey.
November 2009